Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD3P0DMS9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms