Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TYMSP04818 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TYMSP04818 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TYMSP04818 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TYMSP04818 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TYMSP04818 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TYMSP04818 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TYMSP04818 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TYMSP04818 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TYMSP04818 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TYMSP04818 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TYMSP04818 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TYMSP04818 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TYMSP04818 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TYMSP04818 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TYMSP04818 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TYMSP04818 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TYMSP04818 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TYMSP04818 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TYMSP04818 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TYMSP04818 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TYMSP04818 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TYMSP04818 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TYMSP04818 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TYMSP04818 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TYMSP04818 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TYMSP04818 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TYMSP04818 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TYMSP04818 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TYMSP04818 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TYMSP04818 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TYMSP04818 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TYMSP04818 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TYMSP04818 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TYMSP04818 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TYMSP04818 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TYMSP04818 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TYMSP04818 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TYMSP04818 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TYMSP04818 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TYMSP04818 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TYMSP04818 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TYMSP04818 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TYMSP04818 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TYMSP04818 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TYMSP04818 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TYMSP04818 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TYMSP04818 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TYMSP04818 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TYMSP04818 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TYMSP04818 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TYMSP04818 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TYMSP04818 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TYMSP04818 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TYMSP04818 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TYMSP04818 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TYMSP04818 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYMSP04818 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYMSP04818 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYMSP04818 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYMSP04818 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYMSP04818 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYMSP04818 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TYMSP04818 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms