Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EGFRP00533 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EGFRP00533 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EGFRP00533 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EGFRP00533 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EGFRP00533 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EGFRP00533 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EGFRP00533 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EGFRP00533 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EGFRP00533 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EGFRP00533 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EGFRP00533 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EGFRP00533 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EGFRP00533 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EGFRP00533 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EGFRP00533 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EGFRP00533 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EGFRP00533 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EGFRP00533 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EGFRP00533 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EGFRP00533 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EGFRP00533 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EGFRP00533 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EGFRP00533 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EGFRP00533 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EGFRP00533 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EGFRP00533 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EGFRP00533 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EGFRP00533 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EGFRP00533 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EGFRP00533 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EGFRP00533 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EGFRP00533 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EGFRP00533 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EGFRP00533 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EGFRP00533 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EGFRP00533 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EGFRP00533 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EGFRP00533 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EGFRP00533 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EGFRP00533 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EGFRP00533 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EGFRP00533 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EGFRP00533 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EGFRP00533 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EGFRP00533 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EGFRP00533 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EGFRP00533 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EGFRP00533 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EGFRP00533 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EGFRP00533 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EGFRP00533 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EGFRP00533 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EGFRP00533 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EGFRP00533 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EGFRP00533 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EGFRP00533 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EGFRP00533 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EGFRP00533 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EGFRP00533 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EGFRP00533 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EGFRP00533 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EGFRP00533 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EGFRP00533 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EGFRP00533 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EGFRP00533 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EGFRP00533 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EGFRP00533 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EGFRP00533 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EGFRP00533 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EGFRP00533 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EGFRP00533 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EGFRP00533 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EGFRP00533 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EGFRP00533 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EGFRP00533 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EGFRP00533 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EGFRP00533 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EGFRP00533 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EGFRP00533 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EGFRP00533 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EGFRP00533 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EGFRP00533 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EGFRP00533 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EGFRP00533 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EGFRP00533 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EGFRP00533 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EGFRP00533 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EGFRP00533 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EGFRP00533 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EGFRP00533 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EGFRP00533 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EGFRP00533 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EGFRP00533 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EGFRP00533 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EGFRP00533 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EGFRP00533 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EGFRP00533 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EGFRP00533 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EGFRP00533 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms