Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD4O60885 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD4O60885 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD4O60885 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD4O60885 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD4O60885 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD4O60885 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD4O60885 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD4O60885 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD4O60885 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD4O60885 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD4O60885 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD4O60885 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD4O60885 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD4O60885 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD4O60885 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD4O60885 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD4O60885 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD4O60885 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD4O60885 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD4O60885 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD4O60885 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD4O60885 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD4O60885 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD4O60885 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD4O60885 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD4O60885 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD4O60885 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BRD4O60885 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD4O60885 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD4O60885 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD4O60885 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD4O60885 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD4O60885 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD4O60885 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD4O60885 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD4O60885 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD4O60885 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD4O60885 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD4O60885 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD4O60885 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD4O60885 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD4O60885 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD4O60885 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD4O60885 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD4O60885 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
BRD4O60885 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD4O60885 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD4O60885 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD4O60885 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD4O60885 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD4O60885 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD4O60885 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD4O60885 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD4O60885 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD4O60885 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD4O60885 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD4O60885 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD4O60885 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD4O60885 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD4O60885 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD4O60885 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD4O60885 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD4O60885 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD4O60885 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRD4O60885 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD4O60885 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD4O60885 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD4O60885 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD4O60885 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD4O60885 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD4O60885 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD4O60885 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD4O60885 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD4O60885 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD4O60885 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD4O60885 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD4O60885 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD4O60885 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD4O60885 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD4O60885 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRD4O60885 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRD4O60885 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRD4O60885 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRD4O60885 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRD4O60885 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRD4O60885 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRD4O60885 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRD4O60885 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRD4O60885 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRD4O60885 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRD4O60885 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
BRD4O60885 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRD4O60885 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRD4O60885 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRD4O60885 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRD4O60885 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRD4O60885 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRD4O60885 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRD4O60885 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms