Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms