Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLOCKO15516 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms