Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
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