Protein–RNA interactions for Protein: O00148

DDX39A, ATP-dependent RNA helicase DDX39A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39AO00148 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX39AO00148 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX39AO00148 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX39AO00148 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX39AO00148 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX39AO00148 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX39AO00148 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX39AO00148 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX39AO00148 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX39AO00148 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX39AO00148 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX39AO00148 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX39AO00148 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX39AO00148 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX39AO00148 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX39AO00148 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX39AO00148 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX39AO00148 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX39AO00148 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX39AO00148 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX39AO00148 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms