Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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LINC00587B1AMM8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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LINC00587B1AMM8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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LINC00587B1AMM8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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LINC00587B1AMM8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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LINC00587B1AMM8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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LINC00587B1AMM8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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LINC00587B1AMM8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00587B1AMM8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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