Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NOTOA8MTQ0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms