Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PSDA5PKW4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSDA5PKW4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms