Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms