Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 MIPOL1-202ENST00000396294 6258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 ELP2-203ENST00000358232 8459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 MRPS31P5-201ENST00000416599 3494 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AL390195.2-201ENST00000564771 2023 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 NLRP9P1-201ENST00000540920 2655 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 ZNF611-203ENST00000540744 4417 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 IL22-201ENST00000328087 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 SMARCA2-211ENST00000417599 980 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AL645568.1-202ENST00000437190 1016 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 GCSHP1-201ENST00000512554 484 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC007611.1-202ENST00000564212 854 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 TEX46-202ENST00000566855 510 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 LINC01572-204ENST00000570035 831 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 RBM27-201ENST00000265271 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 CD46-205ENST00000358170 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 ANKS1B-220ENST00000550693 3372 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 PARP9-202ENST00000462315 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 PAPPA2-202ENST00000367662 9691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 EZH2-203ENST00000460911 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 EEA1-201ENST00000322349 9875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 SGK1-223ENST00000528577 1850 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC010894.3-201ENST00000442996 2400 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 VPS36-201ENST00000378060 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 LDAH-209ENST00000440866 3728 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 CHRDL1-201ENST00000372042 1934 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 PFKFB1-203ENST00000545676 1591 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 SORBS1-212ENST00000371249 5927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 FMOD-201ENST00000354955 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 RERE-203ENST00000400907 2973 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 PDLIM5-221ENST00000542407 2979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 VDAC1P10-201ENST00000416715 891 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC006333.1-204ENST00000429396 648 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 ZNF385D-AS2-202ENST00000448980 370 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 LAMA1-201ENST00000389658 9657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 LINC00641-202ENST00000555688 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 DPF3-203ENST00000541685 4077 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 HRNR-201ENST00000368801 9623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 ABI1-206ENST00000376140 1446 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 TIMM21-204ENST00000580087 2524 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 IST1-208ENST00000535424 4082 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 COLGALT2-202ENST00000367520 2325 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 PIEZO2-210ENST00000580640 8334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 GPM6A-202ENST00000393658 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 HEATR4-202ENST00000553558 3523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 CBFA2T2-206ENST00000397800 7449 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 LNX1-202ENST00000306888 3757 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 MTMR10-201ENST00000435680 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 IL6-202ENST00000401630 765 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AL445430.2-201ENST00000423149 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 PGBD4P1-201ENST00000473644 407 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 RN7SL153P-201ENST00000486501 292 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC010247.1-201ENST00000527895 759 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 SDHCP4-201ENST00000532834 510 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 DLGAP1-AS3-201ENST00000577649 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 MALAT1-208ENST00000616527 572 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 CACNB4-263ENST00000637779 1772 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 TMPPE-202ENST00000416695 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 NKRF-201ENST00000304449 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 MAGEB18-201ENST00000325250 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 DDHD1-203ENST00000395606 12769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
C4BP0C0L5 AC006213.1-202ENST00000589021 2176 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 ZNF304-201ENST00000282286 4202 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 CDK5RAP2-203ENST00000360822 5551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 MUC3A-201ENST00000379458 11226 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
C4BP0C0L5 FZD10-AS1-201ENST00000505807 10193 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms