Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
V9GY48 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
V9GY48 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
V9GY48 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
V9GY48 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
V9GY48 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
V9GY48 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
V9GY48 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
V9GY48 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
V9GY48 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
V9GY48 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
V9GY48 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
V9GY48 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
V9GY48 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
V9GY48 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
V9GY48 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
V9GY48 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
V9GY48 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
V9GY48 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
V9GY48 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
V9GY48 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
V9GY48 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
V9GY48 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
V9GY48 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
V9GY48 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
V9GY48 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
V9GY48 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
V9GY48 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
V9GY48 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
V9GY48 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
V9GY48 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
V9GY48 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GY48 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GY48 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GY48 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GY48 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GY48 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GY48 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GY48 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GY48 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GY48 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GY48 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GY48 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GY48 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GY48 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GY48 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GY48 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GY48 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GY48 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GY48 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GY48 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GY48 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GY48 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GY48 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
V9GY48 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
V9GY48 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
V9GY48 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
V9GY48 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
V9GY48 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
V9GY48 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
V9GY48 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
V9GY48 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
V9GY48 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
V9GY48 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
V9GY48 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
V9GY48 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
V9GY48 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
V9GY48 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
V9GY48 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
V9GY48 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
V9GY48 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
V9GY48 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
V9GY48 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
V9GY48 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
V9GY48 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
V9GY48 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
V9GY48 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
V9GY48 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
V9GY48 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
V9GY48 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
V9GY48 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
V9GY48 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
V9GY48 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
V9GY48 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
V9GY48 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
V9GY48 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
V9GY48 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
V9GY48 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
V9GY48 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
V9GY48 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
V9GY48 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
V9GY48 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
V9GY48 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
V9GY48 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
V9GY48 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
V9GY48 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
V9GY48 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
V9GY48 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
V9GY48 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
V9GY48 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms