Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF1Q9Y6D6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARFGEF1Q9Y6D6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms