Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms