Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9Y3F1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9Y3F1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms