Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms