Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN42

ATP1B4, Protein ATP1B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B4Q9UN42 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
ATP1B4Q9UN42 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP1B4Q9UN42 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms