Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN16Q9UKR8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms