Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEFF2Q9UIK5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEFF2Q9UIK5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms