Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDH10Q9P2E7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms