Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA13Q9P0J0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms