Protein–RNA interactions for Protein: Q9P013

CWC15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC15Q9P013 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CWC15Q9P013 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms