Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC9

SMARCAL1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAL1Q9NZC9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCAL1Q9NZC9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCAL1Q9NZC9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCAL1Q9NZC9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCAL1Q9NZC9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCAL1Q9NZC9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCAL1Q9NZC9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCAL1Q9NZC9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCAL1Q9NZC9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCAL1Q9NZC9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCAL1Q9NZC9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCAL1Q9NZC9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCAL1Q9NZC9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCAL1Q9NZC9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMARCAL1Q9NZC9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMARCAL1Q9NZC9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMARCAL1Q9NZC9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMARCAL1Q9NZC9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMARCAL1Q9NZC9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCAL1Q9NZC9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms