Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms