Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDAP2Q9NXN4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDAP2Q9NXN4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms