Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVK13-1Q9NX77 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms