Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms