Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPRD1BQ9NQG5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms