Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
BRMS1Q9HCU9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms