Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM55Q9BYV6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms