Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms