Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms