Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms