Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSG1Q9BU20 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms