Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms