Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC85AQ96PX6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC85AQ96PX6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms