Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC3BQ96NL0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms