Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL15Q96M94 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms