Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms