Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM46AQ96IP4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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