Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALML4Q96GE6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CALML4Q96GE6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms