Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms