Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX21Q969T3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX21Q969T3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX21Q969T3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX21Q969T3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX21Q969T3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX21Q969T3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX21Q969T3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX21Q969T3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX21Q969T3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX21Q969T3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX21Q969T3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX21Q969T3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX21Q969T3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX21Q969T3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms