Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKD2Q969F2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKD2Q969F2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKD2Q969F2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NKD2Q969F2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NKD2Q969F2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKD2Q969F2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NKD2Q969F2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKD2Q969F2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKD2Q969F2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKD2Q969F2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKD2Q969F2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKD2Q969F2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKD2Q969F2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKD2Q969F2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKD2Q969F2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NKD2Q969F2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NKD2Q969F2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKD2Q969F2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NKD2Q969F2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKD2Q969F2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NKD2Q969F2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NKD2Q969F2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKD2Q969F2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NKD2Q969F2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKD2Q969F2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NKD2Q969F2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKD2Q969F2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKD2Q969F2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKD2Q969F2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NKD2Q969F2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKD2Q969F2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKD2Q969F2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NKD2Q969F2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKD2Q969F2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKD2Q969F2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKD2Q969F2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKD2Q969F2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKD2Q969F2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NKD2Q969F2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKD2Q969F2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NKD2Q969F2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NKD2Q969F2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NKD2Q969F2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NKD2Q969F2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKD2Q969F2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKD2Q969F2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKD2Q969F2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKD2Q969F2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms