Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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