Protein–RNA interactions for Protein: Q92618

ZNF516, Zinc finger protein 516, humanhuman

Predictions only

Length 1,163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF516Q92618 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF516Q92618 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms