Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE22Q8NFJ8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms