Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCX0

CCDC150, Coiled-coil domain-containing protein 150, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC150Q8NCX0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC150Q8NCX0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC150Q8NCX0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms